外资蜂拥而来，最普遍的问题是避税严重、税负不公，以至于“长亏不倒”、“越亏损越投资”。2003年我国外商投资企业平均亏损面达51%～55%，与此同时投资额却在不断攀升。据估算，2004年外资企业涉嫌逃税300亿元　6。
从1997年到2003年，如果按“实际纳税/产值”测算，内资企业承担的实际税率，大约比外资企业平均高出6～8个百分点；如果与港澳台资企业平均税率比较，内资企业的税率要高出8～16个百分点！当然，从名义上看，税法规定的名义税率并没有如此大的差别，“优惠”主要体现在地方政府掌握的“豁免”与“减半征税”上　7。
那么，能否实现内外资企业统一税率呢？目前看来还有阻力，主要是担心税收优惠降低后，外资会撤走。国家财政部、税务总局、商务部在这个问题上与地方政府存在着分歧。
一项实证调查表明，1996～2003年的每一年，外资企业在我国境内的投资区域，与税率都是正相关的。也就是说，税负高的地区外资企业投资多，反之则少。例如在上海、北京等地，外资企业的纳税/产值比率高达19%，可是外资仍然蜂拥而来；内蒙古的外资企业2003年所承担的实际税率只有2.3%，可是外资仍然去得很少。这表明，外资企业的直接投资和税率之间关联不大。